La seremi es abogada de la Universidad Gabriela Mistral, y ha tenido una extensa actividad profesional durante los últimos 15 años, en que se especializó en temas medio ambientales.

Pinochet se desempeñó como directora de proyectos de la ONG FIMA, a cargo del programa de participación ciudadana en estudios de impacto ambiental, y de la postulación a fondos de cooperación internacional y del gobierno. Además, estuvo a cargo del programa de educación ambiental al Poder Judicial, y se desempeñó en trabajos comunitarios con organizaciones de base.

Fernanda Pinochet también laboró en la fundación Aerobiología y Pólenes como asesora en planificación institucional y en  proyectos y convenios corporativos.

Además, la nueva seremi fue profesora universitaria de la cátedra derecho y legislación ambiental, y ha participado en diversos cursos, congresos y seminarios nacionales e internacionales.